Dr. Stefan Lang am 11. Mai 2023
Literatur-Recherche Medizin: Suchen mit PubMed
Kategorie Schreib- und Publikationsprozess
Wer seine medizinische Doktorarbeit oder einen wissenschaftlichen Originalartikel schreiben möchte, muss irgendwann nach geeigneten Quellen suchen. Die richtige Literatur-Datenbank für den Bereich Medizin und Life Science ist PubMed. Hier geht es um die wichtigsten PubMed-Tools für die zielgerichtete und valide Literaturrecherche, mit Video und Kurzanleitung im Download.
Themen und Beispiel
Was muss man wissen, um PubMed beim Schreiben seiner medizinischen Doktorarbeit zu nutzen?
- Schnellsuche zum Einstieg
- geeignete Suchbegriffe: MesH-Terms und Key-Words
- PubMed-Suche: Suchbegriffe kombinieren mit Boolschen Operatoren
- wichtige Filter, um PubMed-Ergebnisse einzugrenzen
Übungsbeispiel Literaturrecherche
Nehmen wir einmal an, Sie arbeiten in der Indikation Diabetes mellitus. In Ihrem Forschungsprojekt haben Sie eine App getestet, die Patienten helfen soll, eine bestimmte Diät einzuhalten. Sie haben also drei Themen, zu denen Sie eine Literatur-Recherche durchführen möchten:
Schnellsuche zum Einstieg
Für den Einstieg in die Literatursuche geben Sie die Suchbegriffe „Diabetes mellitus“, „App“ und „Diet“ in das Pubmed-Suchfeld ein. Kombinieren Sie diese mit „AND“ (Boolscher Operator: alle drei Suchbegriffe müssen auftauschen).
Da es um einen ersten Überblick geht, wählen Sie dann bei den Filtern auf der linken Seite „Review“. Lassen Sie sich die aktuellsten Übersichtsarbeiten anzeigen, indem Sie unter „Display Options“ (oben rechts) „most recent“ anklicken.
Wichtig: Wenn Sie einen oder mehrere Reviews lesen, dann notieren Sie sich die „Key-Words“, die in den Artikeln z.B. für „App“ oder „Diät“ benutzt werden.
Systematische Suche
Dokumentation der Literaturrecherche
Eine Schnellsuche zum Einstieg ist ok, aber eine systematische Literaturrecherche solle man planen und dokumentieren. Erstellen Sie sich also eine Word-Datei und notieren Sie Ihre Such-Themen zusammen mit einem Platzhalter für „MeSH-Terms“ und „Key-Words“:
- #1 Diabetes (MeSH-Terms, Key-Words)
- #2 App (MeSH-Terms, Key-Words)
- #3 Diät (MeSH-Terms, Key-Words)
MesH-Terms
MeSH-Terms (Medical Subject Headings) sind standardisierte Schlagwörter, die Thema und Inhalt eines Artikels repräsentieren. Bei PubMed gibt es dafür eine eigene MeSH-Datenbank.
Wenn Sie hier nach Suchbegriffen recherchieren, werden Sie feststellen, dass mit einem einzigen Mesh-Term (z.B. Diabetes mellitus) sehr viele Suchbegriffe bereits abgedeckt sind (z.B. alle Diabetes Subtypen, siehe MeSH-Liste auf der Ergebnisseite unten).
Haben Sie einen passenden MeSH-Term gefunden, klicken Sie auf „Add to search builder“ oben rechts und kopeiren Sie sich die Suchphrase, zum Beispiel: „Diabetes Mellitus“[Mesh]
Die eckige Klammer [Mesh] wird PubMed später sagen, dass in der MeSH-Datenbank gesucht werden soll. Die Anführungszeichen sorgen dafür, dass nur die Kombi „Diabetes mellitus“, aber nicht die einzelnen Worte gesucht werden.
- „Diabetes Mellitus“[Mesh]
Key-Words
Warum braucht man zusätzlich zu den MeSH-Terms noch andere Suchbegriffe? Weil es manchmal, etwa bei sehr seltenen Erkrankungen, keine MeSH-Terms gibt. Oder weil sehr aktuellen Artikeln noch keine MeSH-Terms zugeordnet wurden.
Nehmen Sie also die Suchbegriffe, die Sie in der Schnell-Suche identifiziert haben. Benutzen Sie das Sternchen, um mögliche Varianten eines Begriffs abzudecken (technolog* = technology & technologies). Wenn Sie möchten, dass die Suchbegriffe nur im Titel oder Abstract auftauchen, setzen Sie [tiab] dahinter:
- „mobile technolog*“[tiab] = mobile technology & mobile technologies (nur in Titel oder Abstract)
- nutrition*[tiab] = nutrition & nutritional (nur in Titel oder Abstract)
Boolsche Operatoren: Suchbegriffe kombinieren
OR
„Oder“ bedeutet, dass entweder der eine oder der andere Suchbegriff in einer Quelle auftauchen darf. Wenn man also zum Beispiel nach Suchbegriffen für eine App sucht, könnte das so aussehen:
- „Mobile Applications“[Mesh] OR „mobile technolog*”[tiab] OR mHealth[tiab]
AND
„Und“ heißt, dass jeweils alle Suchbegriffe in einer Quelle auftauchen müssen. Das „AND“ werden wir im nächsten Schritt benötigen.
PubMed-Suche
Such-Phrasen
Wenn ich nach Literatur suche, führe ich für die drei Themengebiete zunächst getrennte Suchen mit den kombinierten Suchbegriffen (Such-Phrase) durch. Denn so sieht man bei den PubMed-Ergebnissen sofort, wie viele Artikel man jeweils gefunden hat. Eine sehr kleine Zahl kann darauf hinweisen, dass man noch nicht alle richtigen Key-Words berücksichtigt hat.
- #1 Diabates: „Diabetes Mellitus“[Mesh]
- #2 App: „Mobile Applications“[Mesh] OR „mobile technolog*”[tiab] OR mHealth[tiab]
- #3 Diät: „Diet Therapy“[Mesh] OR Diet[tiab] OR nutrition[tiab]
Kombination
Haben Sie einzeln nach diesen Such-Phrasen gesucht, gehen Sie bei PubMed auf „Advanced Search“. Dort wird die Search-History angezeigt, also Ihre einzelnen Suchen, jeweils mit #1, #2, #3 etc. gekennzeichnet.
Da Sie möchten, dass die gefundenen Quellen Diabetes UND App UND Diät behandeln, kombinieren Sie die drei Suchen mit dem Boolschen Operator „AND“. Sie müssen nicht erneut die vollständigen Suchphrasen eingeben, sondern können die Nummer (#1 etc.) aus der Search History übernehmen.
- #1 AND #2 AND #3
Filter
Wenn Sie mehrere Hundert Artikel erhalten, dann werden Sie nicht alle lesen können. Mithilfe von Filtern können Sie die Ergebnisse nun weiter einschränken und unter „Advanced Search“ können Sie die Suche weiter verfeinern.
- Filter: Article Type, Publication Date
- Advanced Search: weitere Suchfelder (z.B. Namen von Autoren/Autorinnen, Journals etc.)
Cite
Haben Sie geeignete Literatur gefunden, dann sollten Sie alle Angaben, die Sie fürs Zitieren brauchen, sofort und direkt in Ihre Literaturverwaltungssoftware überführen. Hierzu gibt es die Funktion „Cite“.
Mit CITE können Sie alle notwendigen bibliografischen Angaben direkt und (meist) fehlerfrei speichern – eine große Hilfe.
Fazit
Ich hoffe, meine kleine Schnell-Anleitung für die effektive Literaturrecherche mit Pubmed war hilfreich. Ich würde sagen: Probieren Sie es einfach mal aus. PubMed ist zu weiten Teilen selbsterklärend.
- Zum Download (pdf): Kurzanleitung PubMed-Suche
- Zum Nachgucken gibt es das Ganze auch als YouTube-Video:
Video
Dr. Stefan Lang
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